Во-первых, все участники рынка, получающие непосредственный доступ к торговой системе, заключают с головным депозитарием типовые договора, автоматически становясь так называемыми депозитариями второго уровня, т.е. депозитариями, юридически осуществляющими ведение счетов своих клиентов в разрезе общего клиентского счета в головном депозитарии первого уровня.
Во-вторых, круг депозитарных операций, которые могут совершаться на организованном рынке государственных ценных бумаг, а также порядок их осуществления предопределяются особенностями регулирования и технологического устройства рынка, что не позволяет участникам произвольно расширять этот круг и изменять порядок осуществления операций.
В-третьих, большинство депозитарных операций на организованном рынке ценных бумаг (перевод ценных бумаг на торговый счет биржи для обеспечения участия в торгах, зачисление или списание ценных бумаг по итогам торгов) в соответствии с заключаемыми типовыми депозитарными договорами осуществляется автоматически и не требует непосредственного участия сотрудников организации, выполняющей депозитарные функции. Информация о движении ценных бумаг по счетам в головном депозитарии (в том числе и по счетам клиентов, которые в справочных целях ведутся головной системой) может передаваться депозитариям второго уровня в виде файлов, записанных на электронных магнитных носителях информации. Указанные обстоятельства позволяют достаточно легко автоматизировать депозитарную деятельность и свести к минимуму на ее осуществление.
В-четвертых, выполнение всеми непосредственными участниками рынка с минимальными трудозатратами ограниченного круга одинаковых депозитарных функций, в условиях их жесткой технологической привязки к возможностям и инфраструктуре технического комплекса головного депозитария, а также сложившиеся обычаи обусловили отсутствие практики взимания на организованном рынке государственных ценных бумаг комиссионных вознаграждений за осуществление депозитарной деятельности. Компенсация затрат на эту деятельность практически везде осуществляется за счет комиссий от осуществления брокерских операций.